phát sinh chi phí

Gói thầu của đơn vị tôi là gói tư vấn, theo dự toán lúc đầu là dưới 500 triệu đồng nên tôi chọn hình thức chỉ định thầu, nhưng trong quá trình làm thực tế có phát sinh làm chi phí tăng hơn 500 triệu đồng. Tôi xin hỏi, xử lý trường hợp này như thế nào?